すべての CSS がダウンロードされるまで、ブラウザでのレンダリングが始まらないため、CSS はできるだけ上に書きましょうと言う提言。
また link 要素を使用せずに @import で CSS を読み込んだ場合は、IE で一瞬 CSS が適用されずに素のコンテンツが表示される FOUC (Flash of Unstyled Content) と言う問題が起こります。

これについては、ウチのサイトでは問題は無かった。
普通、スタイルシートは HEAD の外に置くようなことは無いので、あまり気にしなくてもいいのでは？

ただ FOUC については初耳だったので、今後は気をつけるようにしたい。